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RNA甲基化润色——m6A/5mC RNA甲基化定量检测试剂盒

宣布者:艾美捷科技    宣布时候:2021-06-17     
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在原(yuan)生(sheng)(sheng)生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)界、动(dong)物(wu)(wu)界和动(dong)物(wu)(wu)界中(zhong), 遗传(chuan)物(wu)(wu)资 DNA和RNA上存在着(zhe)普遍的核酸化学润(run)色。这一(yi) 特征明显拓(tuo)宽了基(ji)因(yin)组的多样性, 是(shi)调(diao)控核酸从转 录到(dao)转录后抒发的首要手(shou)腕。但是(shi), 与含有20种 差别氨基(ji)酸残基(ji)的卵白质比拟, RNA凡是(shi)只要4种碱(jian) 基(ji)(A、U、G、C)。为(wei)了完成其(qi)布(bu)局和功效的多样性, RNA甲基(ji)化润(run)色作为(wei)转录后程度的首要调(diao)控体(ti)例, 在很多生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)学进程中(zhong)必(bi)不可(ke)少。

 

研讨标明(ming), mRNA(messenger RNA)、tRNA(transfer RNA)、rRNA(ribosomal RNA)、长(zhang)链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)和(he)非编码小(xiao)RNA包含(han) miRNA(microRNA)、siRNA(small interfering RNA)、piRNA(piwi-interacting RNA)]等各类(lei)RNA上均存在(zai)着各类(lei)差(cha)别的(de)化(hua)学(xue)(xue)润(run)色(se)。这(zhei)些(xie)转录后的(de)润(run)色(se)别离由(you)甲基(ji)(ji)转移(yi)酶(mei)(Writers)和(he)去甲基(ji)(ji)转移(yi)酶(mei)(Erasers)在(zai)特定位点上经由(you)过(guo)程酶(mei)促反(fan)映来装置或(huo)移(yi)除, 而甲基(ji)(ji)化(hua)连系卵白(Readers)能够或(huo)许读取润(run)色(se)信息并(bing)为下(xia)流功(gong)效的(de)执 行(xing)通报旌旗灯号(hao)。差(cha)别的(de)化(hua)学(xue)(xue)润(run)色(se)是经由(you)过(guo)程对(dui)应的(de)酶(mei)停止(zhi)催化(hua)构成的(de), 这(zhei)些(xie)酶(mei)具备脱氨基(ji)(ji)(deamination)、甲基(ji)(ji)化(hua)(methylation)、糖基(ji)(ji)化(hua)(glycosylation)、硫醇化(hua)(thiolation)、转糖基(ji)(ji)化(hua)(transglcosylation)和(he)异构化(hua)(isomerization)等多种功(gong)效。

 

化(hua)学(xue)润色的多样性, 和(he)(he)差别位点(dian)上的润色可影响RNA可变(bian)剪接(jie)、运输、 折(zhe)叠、稳(wen)定性等差别层(ceng)面(mian)的功效。RNA润色可间(jian)接(jie)影响RNA的化(hua)学(xue)性子(zi), 包含所带电荷、碱基(ji)配对(dui)、二级布局和(he)(he)卵白质(zhi)-RNA彼此(ci)感化(hua)等, 这些变(bian)更又(you)经由过(guo)程节制 RNA加工、定位、翻(fan)译和(he)(he)终究的衰(shuai)变(bian)来调控基(ji)因抒发。此(ci)中以m6A(N6- methyladenosine)、m1 A(N1 -methyladenosine)、5mC(5- methylcytosine)的RNA甲基(ji)化(hua)润色最(zui)为罕(han)见。

 

RNA甲基化润色的催化机制.jpg

1 RNA的m6A润色

m6A便(bian)是(shi)在腺苷6位(wei)的(de)N原子(zi)上(shang)拔出(chu)一个甲(jia)(jia)基(ji)代替基(ji),RNA转录(lu)本上(shang)的(de)各(ge)类(lei)化(hua)学润色(se)中m6A含量(liang)最为丰硕, m6A润色(se)的(de)首要功效(xiao)是(shi)影响RNA的(de)翻译和稳(wen)定(ding)性。m6A甲(jia)(jia)基(ji)化(hua)润色(se)首要由相干的(de)催化(hua)酶催化(hua)构成(cheng), METTL3(methyltransferase-like 3)和METTL14(methyltransferase-like 14)连系构成(cheng)的(de)异二聚体METTL3/METTL14是(shi)典范的(de)m6A甲(jia)(jia)基(ji)转移(yi)酶复合物, 担任大部分哺乳动物细(xi)胞内 mRNA的(de) m6A甲(jia)(jia)基(ji)化(hua)润色(se)。细(xi)胞内m6A甲(jia)(jia)基(ji)化(hua)润色(se)程(cheng)度不是(shi)静态稳(wen)定(ding)的(de), 其(qi)遭到细(xi)胞表(biao)里身分调控时具(ju)备静态可逆性。细(xi)胞内m6A甲(jia)(jia)基(ji)化(hua)润色(se)首要经由过程(cheng) RNA连系卵(luan)白阐扬生物学感化(hua)。

 

2 RNA的m1A润色

m1A是由(you)甲(jia)基转(zhuan)移(yi)酶催化(hua)(hua)的(de)(de)(de)别的(de)(de)(de)一种首要的(de)(de)(de)RNA转(zhuan)录后润色 , 它普遍存在于 tRNA、mRNA、rRNA和线(xian)粒体 DNA编码(ma)的(de)(de)(de)转(zhuan)录本中。与m6A差别, m1A润色的(de)(de)(de)腺苷酸在N1位点产生甲(jia)基化(hua)(hua)。该位点位于沃森–克(ke)里克(ke)双螺旋(xuan)布(bu)局的(de)(de)(de)碱基配对(dui)界面 , 从而阻(zu)断了(le)腺嘌呤与胸腺嘧啶或尿苷的(de)(de)(de)互补配对(dui), 并对(dui)部分RNA布(bu)局或卵白质-RNA彼此感化(hua)(hua)构成影响。

 

3 RNA的5mC润色

RNA的5mC润色(se)是指RNA胞嘧啶的第(di)5位C原子产生甲(jia)(jia)基(ji)(ji)化(hua), 该润色(se)也是静(jing)态可逆的, 首要以SAM 作为甲(jia)(jia)基(ji)(ji)供(gong)体, 在(zai)甲(jia)(jia)基(ji)(ji)转移酶催化(hua)下构成(cheng)。5mC润色(se)普遍散布在(zai)rRNA、mRNA、tRNA、snRNA(small nuclear RNA)、miRNA、lncRNA和(he)加(jia)强子相干的RNA(enhancer RNA, eRNA)中。RNA 5mC特同性甲(jia)(jia)基(ji)(ji)转移酶包含 NSUN家属卵白(bai)和(he)DNMT2(DNA methyltransferase 2), 其布局特点(dian)是含有激进(jin)的半胱(guang)氨酸残(can)基(ji)(ji) , 能(neng)够或许以SAM为甲(jia)(jia)基(ji)(ji)供(gong)体, 催化(hua)甲(jia)(jia)基(ji)(ji)转移到(dao)响应的RNA胞嘧啶残(can)基(ji)(ji)上。

 

今朝对甲(jia)基化RNA所用(yong)的(de)检测手艺包含高(gao)(gao)通量测序、比色法和液(ye)相(xiang)色谱质谱联用(yong)(LC-MS)等。艾(ai)美捷科(ke)技作为专业(ye)的(de)性命(ming)迷信范畴处理(li)计划供给商,为您保(bao)举Epigentek品牌的(de)滞销(xiao)特点产物,助你颁(ban)发(fa)多篇高(gao)(gao)分文(wen)章。


中文称号英文称号货号规格
M6A RNA甲基化定量检测试剂盒(比色法)EpiQuik M6A RNA Methylation Quantification Kit(Colorimetric)P-900548reactions
96reactions
 M5C RNA甲基化定量检测试剂盒(荧光法)MethylFlash 5-mC RNA Methylation ELISA Easy Kit (Fluorometric)P-900948reactions
96reactions



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